La administración es la prestadora de servicios central para las comunidades y la dirección de Iglesia y vela sobre el cumplimiento de las condiciones marco organizativas y jurídicas. El objetivo de los empleados de la administración y de los secretariados es facilitar el trabajo de los asistentes espirituales en el lugar, descargándolos de actividades administrativas.

La asistencia espiritual y el seguimiento organizado de las aproximadamente 40 comunidades en España, están a cargo del Apóstol Rolf Camenzind y le asiste el Obispo Víctor Alganza.

Actualmente, la Iglesia Nueva Apostólica en España cuenta con 9 distritos, que atienden a casi 3.000 miembros.

Baleares y Canarias
El Obispo Alganza dirige ambos distritos. En Canarias es asistido por el Evangelista de Distrito Claus Ruthardt.

Cataluña
El Evangelista de Distrito David Suter dirige el distrito junto con el Ayudante de Dirigente de Distrito, Pastor Javier Luiso.

Centro
El Pastor Uli Kaim dirige el distrito.

Levante
El Anciano de Distrito Julio Luján dirige el distrito.

Norte
El Anciano de Distrito Pablo Morán dirige el distrito.

Noroeste
El Anciano de Distrito Fernando Docampo dirige el distrito.

Sur
El Evangelista de Distrito Carlos Beunza dirige el distrito.

Sureste
El Evangelista de Distrito Germán Martyniuk dirige el distrito junto con el Ayudante de Dirigente de Distrito, Evangelista de Distrito Marcelo Fresco.